新冠病毒突变了!部分检测试剂盒将失效!

到目前为止,2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组被认为比SARS-CoV或MERS-CoV更稳定。一项来自杜克-新加坡国立大学医学院的最新的研究显示,SARS-CoV-2已发生一段长度达382个核苷酸的大片段缺失突变(∆382),该缺失突变是SARS-CoV-2病毒感染人类后的第一次重大变异事件,也提示检测该基因片段的新冠试剂盒将失效。研究人员认为该缺失突变会使SARS-CoV-2更适应感染人类宿主,并且该∆382变异的病毒已经传播了至少四周。

先前的研究表明,开放阅读框架8(ORF8)基因片段是SARS相关冠状病毒的进化热点,ORF8区域已被证明在导致2003年”非典“的SARS-CoV的物种间传播、病毒复制效率以及适应人类宿主等方面发挥了重要作用。

来自的一项最新的研究显示,研究人员在8名新加坡住院的SARS-CoV-2感染患者中,发现SARS-CoV-2基因组均存在一段长度达382个核苷酸的大片段缺失突变(∆382),∆382片段几乎完全覆盖了SARS-CoV-2的ORF8基因片段及其转录表达调节序列(TRS),导致ORF8基因不能表达,∆382是SARS-CoV-2病毒进入人类后的第一次重大变异事件。

图示:SARS-CoV-2存在一段长度达382个核苷酸的缺失突变(∆382)

病毒核衣壳内最重要的蛋白之一就是核衣壳蛋白(N,Nucleocapsid Protein),主要负责RNA的复制功能。核衣壳蛋白(N蛋白)常作为新型冠状病毒诊断检测工具,是新冠病毒快速诊断试剂核心原料。∆382片段缺失会增强下游SARS-CoV-2病毒N蛋白基因的转录表达。因此,研究人员推测在该片段的缺失可能会导致SARS-CoV-2更适应人类宿主。进一步研究还发现,∆382病毒已经传播了至少四周。

图示:∆382增强下游N蛋白基因的转录表达

最后,鉴于ORF8是SARS相关冠状病毒的进化热点,且已被证明在SARS-CoV的物种间传播、病毒复制效率以及适应人类宿主等方面发挥了重要作用。因此,随着SARS-CoV-2在人类中的持续传播,我们很可能会发现更多的病毒变异。而且后续的研究应当注重∆382 SARS-CoV-2病毒导致的表型变化以及该基因组标记物在分子流行病学调查研究中的应用。

参考文献:

Discovery of a 382-nt deletion during the early evolution of SARS-CoV-2

本文来自精准医学君、医知圈

弗雷赛斯

-浙江大学硕博创建于2015年